Program pembinaan kemandirian bertujuan membekali warga binaan dengan keterampilan kerja yang bermanfaat setelah bebas.
Salah satu program unggulan pembinaan di Lapas Kelas IIA Gorontalo adalah pembinaan kemandirian bagi warga binaan pemasyarakatan.
Kegiatan dilaksanakan di bengkel kerja lapas dengan jenis keterampilan antara lain menjahit, pertanian/hidroponik, dan pengelasan sederhana. Hasil keterampilan warga binaan sebagian dimanfaatkan untuk kebutuhan internal lapas dan sebagian dipasarkan secara terbatas.
Melalui pembinaan ini diharapkan warga binaan memiliki bekal keahlian dan kebiasaan bekerja yang positif sehingga dapat mandiri secara ekonomi saat kembali ke masyarakat.